倪耀军 1,2 , 徐忠能 1 , 陈胜 1 , 王俊 2
  • 1. 南京医科大学附属淮安第一医院 胸外科(江苏淮安 223001);
  • 2. 南京医科大学第一附属医院 胸外科(南京 210029);
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目的 通过全转录组测序分析比较野生型 A549 细胞和顺铂耐药 A549 细胞(A549/DPP)表达谱的差别,揭示非小细胞肺癌(NSCLC)顺铂耐药潜在机制。方法 首先建立 A549/DDP 细胞系,对 A549 和 A549/DDP 进行全转录组测序,分别对 lncRNA-seq,circRNA-seq 和 miRNA-seq 数据进行差异表达以及功能富集分析(KEGG 和 GO 分析)。然后进行全转录组数据联合分析以及 ceRNA 网络的构建。结果 与 A549 细胞系相比,其中 4 517 个 lncRNA 和 123 个 cirRNA 以及 145 个 miRNA 在 A549/DDP 细胞中有差异表达。显著富集在和癌症相关的通路上。miRNA-circRNA-lncRNA-mRNA 四元网络包含了 12 个 miRNA,4 个 cirRNA,23 个 lncRNA 和 9 个 mRNA 节点。经过拓扑学性质分析 hsa-miR-125a-5p 和 hsa-miR-125b-5p 是顺铂耐药相关的关键 miRNA。结论 TNF 信号通路和 p53 信号通路参与了 A549/DPP 耐药机制。hsa-miR-125a-5p 和 hsa-miR-125b-5p 可能是逆转顺铂抗性的潜在靶点。